MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alteromonas macleodii AltDE1 plasmid pAMDE1-300

Total Repeats: 4972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019394	ACT	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863774
2	NC_019394	ACA	2	6	97	102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410863774
3	NC_019394	CTA	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863774
4	NC_019394	GCTTA	2	10	156	165	20 %	40 %	20 %	20 %	410863774
5	NC_019394	CAG	2	6	210	215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410863774
6	NC_019394	GCT	2	6	219	224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410863774
7	NC_019394	TTG	2	6	258	263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410863774
8	NC_019394	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	410863774
9	NC_019394	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863774
10	NC_019394	AGC	2	6	363	368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410863774
11	NC_019394	ATA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863774
12	NC_019394	TGA	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863774
13	NC_019394	AGG	2	6	439	444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410863774
14	NC_019394	TCG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410863774
15	NC_019394	ATG	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863774
16	NC_019394	TGTT	2	8	819	826	0 %	75 %	25 %	0 %	410863775
17	NC_019394	AG	3	6	827	832	50 %	0 %	50 %	0 %	410863775
18	NC_019394	TTA	2	6	869	874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410863775
19	NC_019394	GGC	2	6	884	889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410863775
20	NC_019394	ATC	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863775
21	NC_019394	TAA	2	6	979	984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863775
22	NC_019394	ACT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863775
23	NC_019394	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	410863775
24	NC_019394	GA	3	6	1134	1139	50 %	0 %	50 %	0 %	410863775
25	NC_019394	CAAT	2	8	1182	1189	50 %	25 %	0 %	25 %	410863775
26	NC_019394	TGC	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410863775
27	NC_019394	ATG	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863775
28	NC_019394	CCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410863775
29	NC_019394	T	6	6	1561	1566	0 %	100 %	0 %	0 %	410863775
30	NC_019394	TGT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410863775
31	NC_019394	TGA	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863775
32	NC_019394	AAG	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863775
33	NC_019394	TAT	2	6	1751	1756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410863775
34	NC_019394	A	6	6	1904	1909	100 %	0 %	0 %	0 %	410863776
35	NC_019394	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863776
36	NC_019394	GCTT	2	8	2001	2008	0 %	50 %	25 %	25 %	410863776
37	NC_019394	TGA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863776
38	NC_019394	TTA	2	6	2220	2225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410863776
39	NC_019394	GCG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410863776
40	NC_019394	ATT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410863776
41	NC_019394	TTGT	2	8	2286	2293	0 %	75 %	25 %	0 %	410863776
42	NC_019394	TAT	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410863776
43	NC_019394	TAA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863777
44	NC_019394	CAA	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410863777
45	NC_019394	T	6	6	2541	2546	0 %	100 %	0 %	0 %	410863777
46	NC_019394	ACT	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863778
47	NC_019394	CTT	2	6	2619	2624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863778
48	NC_019394	CG	3	6	2643	2648	0 %	0 %	50 %	50 %	410863778
49	NC_019394	GCG	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410863778
50	NC_019394	CAA	2	6	2746	2751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410863778
51	NC_019394	GCGTTT	2	12	2766	2777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410863778
52	NC_019394	TCTT	2	8	2891	2898	0 %	75 %	0 %	25 %	410863778
53	NC_019394	AGG	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410863778
54	NC_019394	GAA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863779
55	NC_019394	GGC	2	6	3058	3063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410863779
56	NC_019394	GAA	2	6	3076	3081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863779
57	NC_019394	GAA	2	6	3307	3312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863780
58	NC_019394	AT	3	6	3333	3338	50 %	50 %	0 %	0 %	410863780
59	NC_019394	CTT	2	6	3530	3535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863780
60	NC_019394	ATT	2	6	3661	3666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410863780
61	NC_019394	AAACC	2	10	3713	3722	60 %	0 %	0 %	40 %	410863780
62	NC_019394	G	6	6	3860	3865	0 %	0 %	100 %	0 %	410863780
63	NC_019394	GAT	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863780
64	NC_019394	GAT	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863780
65	NC_019394	CCA	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410863780
66	NC_019394	ATA	2	6	4035	4040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863780
67	NC_019394	AGG	2	6	4198	4203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410863781
68	NC_019394	CTA	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863781
69	NC_019394	GTA	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863782
70	NC_019394	TCTG	2	8	4449	4456	0 %	50 %	25 %	25 %	410863782
71	NC_019394	AAT	2	6	4477	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863782
72	NC_019394	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863782
73	NC_019394	GGCC	2	8	4526	4533	0 %	0 %	50 %	50 %	410863782
74	NC_019394	GAA	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863782
75	NC_019394	TAG	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863782
76	NC_019394	GAAT	2	8	4619	4626	50 %	25 %	25 %	0 %	410863782
77	NC_019394	ACTT	2	8	4686	4693	25 %	50 %	0 %	25 %	410863782
78	NC_019394	AGA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863782
79	NC_019394	T	8	8	4946	4953	0 %	100 %	0 %	0 %	410863783
80	NC_019394	AAG	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410863783
81	NC_019394	A	6	6	4972	4977	100 %	0 %	0 %	0 %	410863783
82	NC_019394	CTA	2	6	5004	5009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863783
83	NC_019394	ATC	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863783
84	NC_019394	GCCTT	2	10	5033	5042	0 %	40 %	20 %	40 %	410863783
85	NC_019394	CGC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410863783
86	NC_019394	TAGC	2	8	5094	5101	25 %	25 %	25 %	25 %	410863783
87	NC_019394	TTCT	2	8	5191	5198	0 %	75 %	0 %	25 %	410863784
88	NC_019394	TAG	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863784
89	NC_019394	CGT	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410863784
90	NC_019394	GGT	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410863784
91	NC_019394	CTT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863784
92	NC_019394	T	6	6	5450	5455	0 %	100 %	0 %	0 %	410863784
93	NC_019394	ATG	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863785
94	NC_019394	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	410863785
95	NC_019394	CTT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863785
96	NC_019394	TAC	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863786
97	NC_019394	TG	3	6	6025	6030	0 %	50 %	50 %	0 %	410863786
98	NC_019394	GT	3	6	6042	6047	0 %	50 %	50 %	0 %	410863786
99	NC_019394	AGG	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410863786
100	NC_019394	CTT	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863786
101	NC_019394	TA	3	6	6085	6090	50 %	50 %	0 %	0 %	410863786
102	NC_019394	CAC	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410863786
103	NC_019394	CAT	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863786
104	NC_019394	T	6	6	6241	6246	0 %	100 %	0 %	0 %	410863786
105	NC_019394	GAGC	2	8	6247	6254	25 %	0 %	50 %	25 %	410863786
106	NC_019394	CAT	2	6	6307	6312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863786
107	NC_019394	TTAG	2	8	6479	6486	25 %	50 %	25 %	0 %	410863787
108	NC_019394	TCA	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863787
109	NC_019394	TAAC	2	8	6589	6596	50 %	25 %	0 %	25 %	410863787
110	NC_019394	GCC	2	6	6720	6725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410863787
111	NC_019394	TTGT	2	8	6733	6740	0 %	75 %	25 %	0 %	410863787
112	NC_019394	CTGA	2	8	6767	6774	25 %	25 %	25 %	25 %	410863787
113	NC_019394	AATACC	2	12	6797	6808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410863787
114	NC_019394	CAA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410863787
115	NC_019394	GTG	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410863787
116	NC_019394	TCG	2	6	7030	7035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410863787
117	NC_019394	TAA	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863787
118	NC_019394	AGC	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410863788
119	NC_019394	TCA	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863788
120	NC_019394	GATG	2	8	7279	7286	25 %	25 %	50 %	0 %	410863788
121	NC_019394	A	7	7	7327	7333	100 %	0 %	0 %	0 %	410863788
122	NC_019394	TGTC	2	8	7373	7380	0 %	50 %	25 %	25 %	410863788
123	NC_019394	TTC	2	6	7781	7786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863789
124	NC_019394	CCA	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410863789
125	NC_019394	ATC	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863789
126	NC_019394	TGG	2	6	7886	7891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410863789
127	NC_019394	GC	3	6	7901	7906	0 %	0 %	50 %	50 %	410863789
128	NC_019394	GTT	2	6	8058	8063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410863790
129	NC_019394	TG	3	6	8064	8069	0 %	50 %	50 %	0 %	410863790
130	NC_019394	GCCTTT	2	12	8070	8081	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410863790
131	NC_019394	TCT	2	6	8112	8117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863790
132	NC_019394	TC	3	6	8180	8185	0 %	50 %	0 %	50 %	410863790
133	NC_019394	TTC	2	6	8237	8242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410863790
134	NC_019394	AG	3	6	8297	8302	50 %	0 %	50 %	0 %	410863790
135	NC_019394	AAC	2	6	8333	8338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410863790
136	NC_019394	TAA	2	6	8383	8388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410863790
137	NC_019394	CAG	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410863790
138	NC_019394	ATAC	2	8	8415	8422	50 %	25 %	0 %	25 %	410863790
139	NC_019394	GCA	2	6	8448	8453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410863790
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144	NC_019394	GATT	2	8	9061	9068	25 %	50 %	25 %	0 %	410863791
145	NC_019394	GGC	2	6	9184	9189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410863791
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151	NC_019394	ATC	2	6	9522	9527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863791
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246	NC_019394	GCTAT	2	10	15851	15860	20 %	40 %	20 %	20 %	410863797
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249	NC_019394	TACT	2	8	15977	15984	25 %	50 %	0 %	25 %	410863797
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253	NC_019394	ATC	2	6	16156	16161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863797
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256	NC_019394	A	6	6	16558	16563	100 %	0 %	0 %	0 %	410863798
257	NC_019394	CTAA	2	8	16644	16651	50 %	25 %	0 %	25 %	410863798
258	NC_019394	CTA	2	6	16665	16670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863798
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260	NC_019394	CGC	2	6	16709	16714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410863798
261	NC_019394	ATG	2	6	16736	16741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863798
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263	NC_019394	TGC	2	6	17120	17125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410863799
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265	NC_019394	GTTT	2	8	17153	17160	0 %	75 %	25 %	0 %	410863799
266	NC_019394	TGCT	2	8	17162	17169	0 %	50 %	25 %	25 %	410863799
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268	NC_019394	CTTG	2	8	17610	17617	0 %	50 %	25 %	25 %	410863800
269	NC_019394	AT	3	6	17637	17642	50 %	50 %	0 %	0 %	410863800
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302	NC_019394	GAT	2	6	18782	18787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410863802
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393	NC_019394	CAT	2	6	24809	24814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410863811
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